但传统的人工种植存在诸如病虫害发生严重导致的农药泛用而药材农残严重、不同区域不同药农种植的药用植物外形特征各异、产量和质量稳定性差等诸多缺陷。
植物工厂种植的霍山石斛
植物工厂种植的有机金线莲
为什么要在植物工厂里种药材其中草药类的药材种植周期较短，高价值的品种多，加上依托植物工厂成熟的蔬菜种植技术，容易实现大规模生产。
而根茎类药材因为市场需求量大，也会是未来植物工厂药材种植的品类之一。但根茎类药一般种植周期长，水肥管理技术要求高，病害防治困难，这些因素造成了植物工厂根茎类药材种植成本高。
所以根据现有的植物工厂种植技术，根茎类药材种植时可优先选择一年生的根茎类药材，或者进行多年生根茎类药材育苗，如植物工厂一年生人参苗根长比林下一年生人参苗根长提高50%。
无论是草本类、根茎类还是食用菌类药材，进行植物工厂种植都要满足以下几个关键因素：1、种植周期短：种植周期短就意味着一年可以进行多次采收，如果植物工厂药材种植4个月的产量和质量能达到林下1-2年的种植水平，那么植物工厂药材种植就有很大的时间优势，产品上市快有利于控制成本回笼资金。2、需光低：植物工厂的维护成本有40-50%是电费，低光需植物意味着低光强也能正常生长，这会很大程度节约电费成本。3、株高矮，冠幅小：植物高度决定了种植模组固定层高内的层数，层数越多意味着种植面积越大，药材总产量就越高。4、市场价值高：市场价值高的药材才会有高收入，所以高附加值的药材会是未来植物工厂药材种植的首选品种。植物工厂种植优势：1.周年连续高效生产：植物工厂作物种植不受环境气候条件制约，可实现周年连续高效生产，保证中药材供应的稳定性。
2.打破中药材种植地域性限制：植物工厂能通过设施内高精度环境控制，可对基质、水、肥、光、温进行调控，模拟中药材道地产区的种植环境，定向促进药材有效成分的形成和积累，打破中药材种植的地域性限制。
3.无需使用农药：植物工厂封闭式的种植环境，能有效控制病虫害的发生概率，从根源杜绝农药的使用，重金属污染也不可能出现在植物工厂的产品里，使得中药材原料的安全性有了保障。
金线莲基质种植培养期
植物工厂中药材种植需要攻克的技术问题？植物工厂中药材种植的优势在于产量高、周期短、无农残且质量稳定，最为重要的技术问题就是如何保证中药材的品质。
一方面，科研人员需在明确药用植物生理特性的基础上，综合考虑各环境因子的综合作用效果，选择运行成本低、效果好的调控手段进行优化控制。通过在较大空间内优化环境条件，以满足药用植物在不同生长阶段对特定生长条件的需求，达到最佳生长效果，缩短生长周期，提高生产效率。另一方面，利用植物工厂条件可控的优势，人为设计药用植物次生代谢调控措施，促进有效成分合成与积累，提高其药用价值。
通过不断研究试验，一系列高附加值和濒危的药用植物的生长习性已掌握，可利用“植物工厂”模拟野生中草药的生长环境，并通过有效调控手段提高药用有效成分在植物体内的含量，增加经济效益。植物工厂种植药用植物才刚刚起步，将会有越来越多有价值的药用植物入住植物工厂。
